Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF2Q01130 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF2Q01130 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms