Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms