Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D2P62837 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms