Protein–RNA interactions for Protein: P62826

RAN, GTP-binding nuclear protein Ran, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANP62826 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RANP62826 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RANP62826 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RANP62826 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RANP62826 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RANP62826 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RANP62826 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RANP62826 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RANP62826 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms