Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSNL1P62760 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms