Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3EP60228 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms