Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00315P59091 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms