Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA9P57773 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA9P57773 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA9P57773 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA9P57773 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA9P57773 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA9P57773 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA9P57773 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms