Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXCT1P55809 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms