Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP9P55211 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP9P55211 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP9P55211 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP9P55211 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP9P55211 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms