Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRISP3P54108 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms