Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA2P51531 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms