Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNI2P48788 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI2P48788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms