Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A3P48764 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC9A3P48764 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms