Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF4P48230 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF4P48230 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms