Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RANGAP1P46060 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RANGAP1P46060 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms