Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA1P43355 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA1P43355 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA1P43355 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA1P43355 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms