Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTTP42858 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTTP42858 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HTTP42858 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTTP42858 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTTP42858 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTTP42858 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTTP42858 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTTP42858 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms