Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EIF4A3P38919 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms