Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms