Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYH11P35749 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYH11P35749 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYH11P35749 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYH11P35749 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYH11P35749 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYH11P35749 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms