Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 32.6
GTF2F1P35269 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 425.08■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 32.6
GTF2F1P35269 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 32.6
GTF2F1P35269 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.82e-13■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DPH1-216ENST00000576891 537 ntTSL 411.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.894e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.857e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 219.29■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 CHD7-204ENST00000526846 500 ntTSL 217.63■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-216ENST00000584397 622 ntTSL 226.98■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-213ENST00000583499 560 ntTSL 226.31■■□□□ 1.85e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.545e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-211ENST00000582984 823 ntTSL 324.18■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-212ENST00000583111 574 ntTSL 221.3■■□□□ 15e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-206ENST00000580033 547 ntTSL 419.08■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 315.43■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ARHGDIA-204ENST00000578351 421 ntTSL 413.07□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 532.27■■■□□ 2.766e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 530.17■■■□□ 2.426e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.286e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 529.15■■■□□ 2.266e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 328.39■■■□□ 2.146e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.096e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)27.89■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 527.17■■□□□ 1.946e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.926e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.776e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.773e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.766e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RHBDL1-204ENST00000561556 796 ntTSL 325.92■■□□□ 1.744e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RHBDL1-203ENST00000450775 1566 ntTSL 225.9■■□□□ 1.744e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-225ENST00000557415 584 ntTSL 225.73■■□□□ 1.713e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DENND4B-209ENST00000483561 499 ntTSL 425.71■■□□□ 1.716e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 425.7■■□□□ 1.76e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 225.67■■□□□ 1.76e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 225.67■■□□□ 1.76e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-205ENST00000421938 565 ntTSL 325.45■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 225.15■■□□□ 1.626e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.66■■□□□ 1.546e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.486e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 324.23■■□□□ 1.473e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-212ENST00000582429 1824 ntTSL 224.05■■□□□ 1.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-204ENST00000517530 563 ntTSL 224■■□□□ 1.436e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.416e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 423.81■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.46e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 223.6■■□□□ 1.376e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-209ENST00000522479 435 ntTSL 323.05■■□□□ 1.286e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-216ENST00000583060 477 ntTSL 322.79■■□□□ 1.246e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-222ENST00000556426 563 ntTSL 322.52■■□□□ 1.23e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-208ENST00000462106 671 ntTSL 222.43■■□□□ 1.186e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 522.38■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.096e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.086e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-203ENST00000416675 840 ntTSL 521.56■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-224ENST00000557015 628 ntTSL 221.49■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.956e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.926e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 320.8■□□□□ 0.926e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.926e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-212ENST00000553787 579 ntTSL 420.72■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 LRRC42-204ENST00000444987 1044 ntTSL 520.71■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-216ENST00000554867 555 ntTSL 220.59■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-231ENST00000533732 544 ntTSL 520.58■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-217ENST00000473905 1181 ntTSL 520.56■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-206ENST00000448342 720 ntTSL 520.04■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-216ENST00000534472 1561 ntTSL 1 (best)20.01■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.756e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-222ENST00000487956 1145 ntTSL 519.57■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-204ENST00000418037 916 ntTSL 319.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC22A20-201ENST00000525264 1419 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.676e-8■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 105.8 ms