Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms