Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP6P35125 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP6P35125 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP6P35125 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
USP6P35125 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6P35125 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6P35125 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6P35125 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6P35125 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6P35125 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6P35125 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6P35125 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6P35125 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6P35125 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6P35125 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6P35125 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6P35125 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6P35125 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP6P35125 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP6P35125 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP6P35125 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms