Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPC1P35052 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPC1P35052 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms