Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP1P32455 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP1P32455 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP1P32455 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms