Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms