Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB2P29033 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB2P29033 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB2P29033 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJB2P29033 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB2P29033 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB2P29033 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms