Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRBP28702 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRBP28702 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRBP28702 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRBP28702 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRBP28702 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRBP28702 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRBP28702 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRBP28702 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRBP28702 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRBP28702 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRBP28702 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRBP28702 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRBP28702 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRBP28702 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRBP28702 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRBP28702 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms