Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMBRP28336 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMBRP28336 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMBRP28336 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMBRP28336 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NMBRP28336 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMBRP28336 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMBRP28336 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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