Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRYBB3P26998 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRYBB3P26998 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms