Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms