Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTSSP25774 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSSP25774 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSSP25774 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSSP25774 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSSP25774 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSSP25774 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms