Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP100P23497 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP100P23497 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP100P23497 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP100P23497 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP100P23497 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP100P23497 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP100P23497 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP100P23497 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SP100P23497 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms