Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRGP23470 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
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