Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRBP23467 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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