Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D1P20393 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D1P20393 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms