Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms