Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT4P19013 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT4P19013 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT4P19013 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT4P19013 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT4P19013 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT4P19013 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT4P19013 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT4P19013 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms