Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCC1P18754 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCC1P18754 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCC1P18754 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RCC1P18754 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCC1P18754 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCC1P18754 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms