Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRAP18433 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRAP18433 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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