Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF4P18085 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF4P18085 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF4P18085 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms