Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms