Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTLA4P16410 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms