Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB4P16144 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms