Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2RAP15509 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2RAP15509 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2RAP15509 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF2RAP15509 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF2RAP15509 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms