Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEFHP12036 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFHP12036 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFHP12036 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEFHP12036 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEFHP12036 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms