Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VPREB1P12018 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms