Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNAT1P11488 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNAT1P11488 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms