Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms